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無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測期待“大顯身手”

健康報網(wǎng) - 2019-12-04

  3月5日凌晨,國際權(quán)威學(xué)術(shù)雜志《自然》期刊《醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)》發(fā)表了我國學(xué)者完成的一項重要研究成果,該研究為一項擴展性無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測技術(shù)(NIPTPlus)覆蓋更多染色體異常疾病找到了強有力的證據(jù);有望在產(chǎn)前出生缺陷防治工作中,促進擴展性胎兒游離DNA(cfDNA)檢測的臨床應(yīng)用,使更多染色體異常疾病的產(chǎn)前篩查成為現(xiàn)實。這一研究成果很快得到全球同行的高度關(guān)注和認可,引發(fā)了各界對無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測的重視和期望。

  出生缺陷防治——產(chǎn)前篩查是一道重要“關(guān)卡"

  2012年原衛(wèi)生部發(fā)布的《中國出生缺陷防治報告》指出,我國的出生缺陷發(fā)生率約為5.6%,與世界中等收入國家平均水平接近;但由于人口基數(shù)大,每年新增出生缺陷病例總數(shù)龐大,達到約90萬例,已成為影響兒童健康和出生人口素質(zhì)的重大公共衛(wèi)生問題。中南大學(xué)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究中心、中國遺傳醫(yī)學(xué)中心主任鄔玲仟教授表示,出生缺陷病種繁多,目前已知的有8000種~10000種,主要由遺傳因素、環(huán)境因素及兩者相互作用引發(fā)。

  目前,出生缺陷在發(fā)達國家已成為嬰兒死亡的第一位原因,這一趨勢在我國也逐漸顯現(xiàn);出生缺陷也是兒童殘疾的主要原因,因治療、殘疾或死亡導(dǎo)致的疾病負擔巨大。根據(jù)2003年的資料測算,我國每年新出生的唐氏綜合征生命周期的總經(jīng)濟負擔超過100億元,新發(fā)先天性心臟病生命周期的總經(jīng)濟負擔超過126億元。

  鄔玲仟教授表示,嚴重遺傳病是出生缺陷的主要原因,其新生兒發(fā)病率約為2%,主要由染色體異常綜合征(發(fā)病率約為1.6%)和嚴重單基因病(發(fā)病率約為0.4%)組成。染色體異常綜合征又分為常染色體非整倍體綜合征、性染色體非整倍體綜合征、染色體片段缺失/重復(fù)綜合征、染色體微缺失/微重復(fù)綜合征。

  染色體是細胞核中載有遺傳信息的物質(zhì),主要由DNA和蛋白質(zhì)組成。染色體的完整性對于任何生物來說都極為重要,染色體既不能多也不能少,僅僅某條染色體的一小部分出現(xiàn)異常就可能導(dǎo)致致命的后果。唐氏綜合征就是人類21號染色體由正常的一對變?yōu)?條而導(dǎo)致一種遺傳疾病,也稱21-三體綜合征。攜帶這種染色體異常的患兒,有明顯的智能落后、特殊面容、生長發(fā)育障礙和多發(fā)畸形等,是最為常見的染色體異常導(dǎo)致的出生缺陷性疾病。我國唐氏綜合征發(fā)生率約為14.7/萬,每年新增2.3萬~2.5萬例。

  鄔玲仟教授表示,針對胎兒染色體非整倍體的產(chǎn)前篩查技術(shù),主要包括血清學(xué)唐氏篩查、無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測、超聲篩查3種。由于對醫(yī)生的操作技術(shù)具有很高要求,僅有少數(shù)大型三甲醫(yī)院能夠開展針對頸后透明帶等進行的超聲篩查,因此前兩種技術(shù)成為我國主要的篩查手段。

  染色體異常篩查——DNA檢測更接近疾病本質(zhì)

  血清學(xué)唐篩是一種通過檢測孕婦血清中的疾病相關(guān)蛋白濃度,并結(jié)合孕婦的體重、年齡和采血時孕周等因素,計算該孕婦生出先天缺陷胎兒的危險系數(shù)的檢測方法,主要的篩查缺陷包括21-三體綜合征、18-三體綜合征和神經(jīng)管畸形。

  血清學(xué)唐篩的高風險孕婦,需根據(jù)孕周大小選擇絨穿、羊穿、臍穿等穿刺操作,進行最終的產(chǎn)前診斷。鄔玲仟教授表示,盡管血清學(xué)唐篩是目前最主要的篩查手段,但中孕期三聯(lián)血清學(xué)篩查的檢出率僅在70%左右,且有高于5%的假陽性率,讓這一技術(shù)存在明顯的不足。

  結(jié)合我國14.7/萬的唐氏綜合征發(fā)生率,通俗地解釋一下前述兩個數(shù)字:在1萬名接受血清學(xué)唐篩的孕婦中,會有大約500名孕婦被告知為高風險,但接受穿刺診斷后,最終確診的真正唐氏兒只有9~10人;約98%高風險孕婦接受了不必要的穿刺,承受了一定的宮內(nèi)感染和流產(chǎn)風險。此外,在篩查低風險、未接受穿刺診斷的孕婦中,有4~6名唐氏兒被漏診。血清學(xué)唐篩技術(shù)的局限性,決定了每10個唐氏兒中有3~4個會被漏診。

  鑒于血清學(xué)唐篩并不理想的檢出率和陽性預(yù)測值,針對唐氏綜合征的篩查,尋找一項更加精準的產(chǎn)前篩查技術(shù)顯得尤為重要,無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測(NIPT)應(yīng)運而生。NIPT技術(shù)是基于大規(guī)模平行測序技術(shù)平臺,通過對孕婦外周血中游離胎兒DNA的檢測,發(fā)現(xiàn)來自21、18、13號染色體的游離胎兒DNA片段含量的改變,進行胎兒常見染色體非整倍體異常的預(yù)測。

  2012年,原衛(wèi)生部全國產(chǎn)前診斷技術(shù)專家組就該技術(shù)進行了論證,認為NIPT是一種近于診斷水平的產(chǎn)前篩查新技術(shù)。有專家表示,NIPT可以準確鎖定靶向疾病的遺傳學(xué)病因,雖與血清學(xué)唐篩一樣,均取孕婦外周血血樣進行檢測,但其在檢出率、陽性率、陽性預(yù)測值方面均具有顯著的優(yōu)勢,21-三體異常的檢出率可達98%~99%,而假陽性率僅為0.2%。這意味著,在1萬名接受NIPT檢測的孕婦中,僅有1~2名孕婦需要接受不必要的穿刺診斷;在具有更高檢測準確性的同時,NIPT大大減少了由于侵入性產(chǎn)前診斷操作帶來的手術(shù)風險,完全可以取代傳統(tǒng)血清學(xué)唐篩。

  據(jù)初步估算,NIPT進入我國市場以來,已為近1000萬名孕婦提供了檢測服務(wù),檢出了數(shù)萬名三體綜合征患兒。盡管其具有極高的準確性和安全性,但與傳統(tǒng)血清學(xué)唐篩相比,服務(wù)數(shù)量仍遠遠不足,經(jīng)濟因素成為其推廣受阻的主要原因。

  目前,我國開展孕中期唐篩三聯(lián)法的收費一般在200元左右,而且已基本在各地納入財政補助或醫(yī)保報銷,個人實際負擔金額更低;而NIPT最初的收費標準普遍在2000元以上,且沒有相關(guān)財政補助或醫(yī)保報銷政策,但這一狀況應(yīng)該得到改變。鄔玲仟教授曾針對兩種檢測技術(shù),牽頭開展了一項衛(wèi)生經(jīng)濟學(xué)相關(guān)研究,結(jié)果顯示,綜合考慮因假陽性帶來的不必要穿刺診斷、漏診帶來的唐氏兒診療照護帶來的資源消耗等因素,只要例均收費控制在1620元以內(nèi),開展NIPT的社會經(jīng)濟成本就會低于血清學(xué)唐篩,可以帶來更高的社會收益。目前,絕大多數(shù)地方的收費標準已經(jīng)低于這一費用臨界點,廣東省深圳市已將NIPT納入醫(yī)保報銷。

  貢獻中國智慧——染色體異常篩查再解世界難題

  事實上,導(dǎo)致唐氏綜合征的21-三體只是產(chǎn)前診斷發(fā)現(xiàn)的全部染色體異常中的一部分,甚至21、18、13三大染色體三體的占比也僅為1/4左右;其他的染色體異常問題同樣可導(dǎo)致嚴重的出生缺陷,需要在產(chǎn)前篩查和診斷中予以高度重視。

  比如染色體微缺失/微重復(fù)綜合征(MMS)常見的臨床表現(xiàn)包括先天性畸形、器官功能障礙、生長發(fā)育遲緩、智力殘疾、自閉癥等。目前,已被發(fā)現(xiàn)的染色體微缺失/微重復(fù)綜合征有300余種,綜合發(fā)病率遠高于唐氏綜合征的發(fā)病率;而且MMS大多為新發(fā)突變,其發(fā)生與孕婦年齡無關(guān),常規(guī)產(chǎn)前檢測技術(shù)難以發(fā)現(xiàn),將NIPT檢測范圍擴展至染色體微缺失/微重復(fù),也是臨床的迫切需求。

  專家表示,國際上對檢測MMS的探索從未停止。多個國家和地區(qū)的科研院所、臨床機構(gòu)和檢測企業(yè)等已開展大量研究,但對以DiGeorge綜合征為代表的MMS檢測的陽性預(yù)測值均不理想,無法達到臨床一線應(yīng)用的條件。直至不久前,本文開始所述的這項中國研究結(jié)果的發(fā)表,讓人們又重新燃起了希望。

  該研究由中南大學(xué)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究中心、湖南家輝遺傳專科醫(yī)院、湖南省婦幼保健院、聯(lián)合我國一家創(chuàng)新型生物科技公司貝瑞基因共同完成。該研究招募了94085名自然受孕的檢測者,通過無創(chuàng)胎兒游離DNA檢測并行篩查非整倍體綜合征、微缺失/微重復(fù)綜合征,結(jié)果顯示,在成本較低的低測序深度的基礎(chǔ)上,通過拓展性無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測技術(shù)(NIPT-Plus),不僅保持了非整倍體的高陽性預(yù)測值,而且對全基因組MMS也獲得了理想的陽性預(yù)測值,其中最常見的DiGeorge綜合征的陽性預(yù)測值達93%,遠超同期國際同類技術(shù)水平。

  “NIPT技術(shù)亟待升級應(yīng)用,但在推廣至臨床應(yīng)用必須有過硬的臨床研究數(shù)據(jù)支持,我們的研究成果得到了同行的高度肯定。"鄔玲仟教授表示,該領(lǐng)域的國際同行認為這一研究具有里程碑式的意義,“近10萬人的大樣本人群跟蹤隨訪為NIPT-Plus作為臨床一線篩查技術(shù)提供了有力證據(jù),為相關(guān)臨床指南的制定提供了有力支撐"。

  貝瑞基因公司首席信息官于福利博士表示,染色體片段缺失/重復(fù)和MMS的致病性CNVs一般只有幾兆至幾十兆堿基,片段較小;二代測序技術(shù)噪音較大,檢測基因拷貝數(shù)變異很難;孕婦外周血中胎兒DNA含量分布峰值較低、信號微弱等,都是NIPT技術(shù)應(yīng)用于MMS檢測的技術(shù)難點。貝瑞基因利用PCR-free專利技術(shù)實現(xiàn)了較好的降噪效果,新的生物信息算法極大優(yōu)于其他算法,加之臨床團隊和研發(fā)團隊緊密配合促進技術(shù)迭代,共同促成了此次技術(shù)和研究上的重大突破。

  鄔玲仟教授表示,未來在更大范圍內(nèi)實現(xiàn)NIPT及NIPT-Plus技術(shù)在臨床的應(yīng)用,還需要加強教育宣傳工作,讓百姓和醫(yī)務(wù)人員都能意識到NIPT篩查的重要意義;還要加強產(chǎn)前診斷中心的服務(wù)能力建設(shè),NIPT-Plus技術(shù)將覆蓋眾多的染色體異常疾病,要提高醫(yī)務(wù)人員對這些疾病篩查的辨識能力;同時要嚴格篩查技術(shù)開展的質(zhì)量控制和規(guī)范管理。“NIPT-Plus技術(shù)相關(guān)研究的例子,很好地說明了國家提倡的產(chǎn)、學(xué)、研一體化,非常有利于科技和產(chǎn)業(yè)的發(fā)展,最終造福老百姓。"

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