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Illumina與IDbyDNA合作提供NGS疾病檢測解決方案

[db:作者] - 2020-05-28

Illumina與IDbyDNA合作提供NGS感染性疾病檢測解決方案
 
合作旨在通過結合全面的測序工作流程與完善的臨床信息學,
加速NGS在臨床傳染性疾病檢測領域的應用
 
Illumina公司(納斯達克股票代碼:ILMN)昨日宣布與IDbyDNA公司,一家為檢測、鑒定和解讀微生物及其在人類健康中的作用設定標準的宏基因組技術公司建立全球戰略合作伙伴關系,共同為全球微生物市場提供基于新一代測序(NGS)的全面工作流程。
 
根據協議條款,Illumina和IDbyDNA將共同推廣IDbyDNA的Explify®平臺與Illumina的NGS測序平臺和文庫制備產品,將這些產品搭配使用能為感染性疾病應用提供完整的一體化工作流程解決方案。此外,IDbyDNA和Illumina還將共同開發僅供研究使用(RUO)的工作流程。
 
此次合作旨在推動NGS測序平臺、文庫制備試劑以及其他試劑的廣泛應用,為世界各地的實驗室和醫院提供高保真度的NGS分析、解讀和報告能力。其目標是加速和改善感染性疾病檢測。在COVID-19大流行期間,兩家公司已經加快了合作的進程,以此來為全球開展NGS的客戶提供更好的支持,幫助他們進行監測。
 
除了已經對COVID-19的監測提供的支持外,最初的商業化RUO工作流程還將重點關注多種類型的感染,尤其是那些使用NGS比使用當前技術更有獨特價值的感染,同時也會繼續支持COVID-19的監測。這些工作流程利用了Illumina的文庫制備試劑和NGS測序平臺,以及IDbyDNA的Explify平臺。其目標是幫助實驗室開發能全面鑒定病原體,同時還能提供抗菌耐藥性標記相關信息的檢測。
 
Illumina臨床市場營銷副總裁Kathy Davy表示:“我們意識到采用新一代測序方法進行感染性疾病檢測的主要障礙是缺乏簡單且強大的生物信息學軟件,無法將測序儀產生的數據轉化為可操作的報告。IDbyDNA Explify平臺與Illumina NGS測序儀和文庫制備試劑的結合構建了一個強大而全面的感染性疾病工作流程。”
 
“基于NGS的宏基因組檢測能夠最全面地檢測成百上千種病原體,既可用于常規檢測,也可用于新出現的公共衛生威脅,例如導致COVID-19疫情的SARS-CoV-2病毒。更重要的是,我們不僅能夠確定這種新出現的病毒的存在,而且還能破譯單個病毒株的基因組,從而比較各個病毒株,將它們與其他冠狀病毒區分開來,并在診斷時就進行監測活動,”IDbyDNA公司的CCO Jeff Field說道,“隨著全球旅行的增加和經濟一體化,監測和追蹤新型冠狀病毒等病原體的傳播能力成為了一項重大的公共衛生挑戰。通過與NGS領域的領導者合作,我們計劃讓Explify平臺迅速成為全球感染性疾病診斷和監測領域的新標準。”
 
美國第一個將IDbyDNA與Illumina的產品結合起來的臨床實驗室是位于阿拉巴馬州的Synergy實驗室。Synergy目前正在提供首個基于NGS的尿道感染(UTI)綜合性檢測,其中包括約100種尿路病原體、定量分析和371種精選的抗生素耐藥性遺傳標記,該檢測會使用Explify平臺來分析結果。  
 
“我們意識到基于NGS的微生物學檢測是感染性疾病檢測的未來,因此我們正在與Illumina和IDbyDNA合作,將這項新技術引入美國東南部市場,并開始為我們的臨床醫生和患者提供目前最全面的感染性疾病檢測,”Synergy實驗室CEO Brad Pitts說道。
 
IDbyDNA Explify平臺與Illumina NGS測序儀和試劑的結合,旨在為微生物學市場提供首個商業化的工作流程解決方案,幫助實驗室和醫院進行基于NGS的全面診斷,包括廣泛的病原體檢測、抗菌耐藥性檢測和定量分析,從患者樣本中更快地獲得更多信息。
 
關于Explify
Explify平臺可以同時分析任何樣本中數以萬計的微生物和病原體,為醫療保健人員提供有用的信息。該工作流程解決方案能夠讓實驗室針對感染性疾病提供基于NGS的宏基因組檢測。Explify平臺能管理實驗室的工作流程,分析宏基因組數據,并提供用于臨床審查、質量控制和報告的應用程序。Explify為實驗室提供了一種簡化的方法,能讓其提供基于NGS的實驗室自主研發的檢測方法(LDT),這種方法會更加全面且無偏倚。Explify宏基因學分析是一個專有的DNA搜索引擎,可在幾分鐘內分析數千萬個新一代測序read,能夠檢測數萬種不同的微生物。專有的Explify數據庫包含數百萬個精選的DNA和RNA參考序列,可鑒定50,000多種微生物和3,000多種已知的常見和罕見病原體,包括抗菌耐藥性(AMR)。
 
關于IDbyDNA
IDbyDNA已經開發出了革命性的宏基因組技術,可以同時分析任何樣本中數以萬計的微生物和病原體。我們和全球的合作伙伴正在一起為鑒定和了解微生物及其在人類健康中的作用設定標準。www.idbydna.com 
 
關于Illumina
Illumina公司通過解碼基因組而改善人類健康。我們注重創新,這使我們成為DNA測序和芯片技術的全球領導者,并為科研、臨床和應用市場的客戶提供服務。我們的產品應用在生命科學、腫瘤學、生殖保健、農業及其他新興市場上。如需了解更多信息,請訪問www.illumina.com或關注@illumina。
 
關于Synergy實驗室
Synergy實驗室是一個提供全方位服務的診斷實驗室,它可以利用各種創新平臺來改善患者護理。  Synergy成立于2015年,由Brad Pitts和Brandon Biles創立,其使命是為醫療保健領域提供合乎道德規范的服務,并為醫療保健人員提供優質的服務和準確的結果。近年來,Synergy一直在引進最新技術來為不斷增長的客戶群提供服務。  其中有許多令人激動的消息。如需了解更多信息,請訪問www.synergytesting.com,或通過LinkedIn與我們聯系,您還可以關注@SynergyTests。
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