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活動:表達譜挖掘云平臺GENEVESTIGATOR®免費試用

[db:作者] - 2020-08-18

目前,全球累積確診感染新型冠狀病毒的人數突破一百六十萬,各地的科學家和研究人員都在緊鑼密鼓地開展相關研究,期望能找出盡快結束這場戰役的方法。作為致力于基因組學分析的一員,上海康昱盛也希望能在自己的領域盡一份綿薄之力。

在上月,康昱盛聯合凱杰公司開展了IPA & CLC軟件的免費試用活動,其中IPA能夠助力揭示新冠感染機制和潛在靶點,CLC能夠助力分析新冠基因序列和進化路線。而現在,康昱盛聯合NEBION公司,為正在新冠研究一線奮斗的科研人員提供了另一款強大的分析軟件的免費試用:

轉錄組表達譜挖掘比對平臺GENEVESTIGATOR®免費試用一個月!
沒有新冠轉錄組數據?沒有分析方向?GENEVESTIGATOR®為您輕松解決!


GENEVESTIGATOR®是基因表達的高性能搜索引擎。它集成了上萬由專家人工統一精選、注釋與歸一化的公共基因芯片和二代測序的實驗結果,包含了各大開源或私人的數據庫中的表達譜,全部樣本數目超過32萬,人類樣本數目超過23萬,用于人類的基因芯片或測序平臺多達26種,所涉及的疾病超過500種。GENEVESTIGATOR®將基因在不同的生物環境,包括疾病、藥物、組織部位、腫瘤、細胞系或基因型之中的表達進行了可視化,以探索不同生物環境下不同基因的表達情況以及基因與生物環境的潛在深層聯系。

 
導向1:從基因出發,探索新冠相關基因在不同情況下的表達

在前期的新冠研究中,科學家已經發掘出一系列新冠相關基因。而GENEVESTIGATOR®可以探索這些特定基因在不同生物環境下的表達情況,包括不同組織、細胞系、癌癥、疾病、藥物和發育期。研究人員可以自由探索新冠相關基因(如新冠重要受體ACE2)在不同組織中的表達情況,判斷病毒影響較大的人體組織器官,推斷新冠影響人體的路徑;可以探索新冠相關基因在不同性別或年齡層的表達情況,研究病毒針對男女或老年人年輕人的不同影響;甚至可以探索新冠相關基因在不同藥物或化合物中的表達情況,挖掘潛在治療新冠病毒感染的藥物。以上這些探索不需要研究人員提供數據,GENEVESTIGATOR®能直接提供分析靈感和文獻支持。



導向2:從生物環境出發,探索新冠可能影響的特定基因

新冠屬于β型冠狀病毒,和SARS-CoV的基因序列具有很高的相似性,并且共享相同的細胞表面受體ACE2。GENEVESTIGATOR®可以找出在特定生物環境下,包括不同組織、細胞系、癌癥、疾病、藥物和發育期,高表達或低表達的基因。例如,可以計算挑出在SARS-CoV影響下特異性高表達或低表達的基因,這些基因很有可能同樣在新冠影響下特異性表達,甚至可以成為疾病marker或者治療新冠的靶點候選。



導向3:結合基因與生物環境,探索新冠相關基因之間的潛在聯系

同時,GENEVESTIGATOR®還支持相關性分析,挖掘出更多在不同生物環境下和目標新冠相關基因具有潛在關聯性的基因,還可以對這些基因進行聚類分析和功能富集分析,進一步探索它們的內部聯系和生物功能。此外,如果研究人員能夠提供新冠患者轉錄組數據,GENEVESTIGATOR®還能夠計算找出在表達量上具有逆轉關系的用藥情況,即可能對于新冠具有治療效果的潛在藥物。



活動須知

1.  活動時間:即日起至4月30日。
2.  申請條件:
a)科研院校PI或商業單位發送關于軟件的試用申請(請使用單位郵箱,而非通用郵箱如QQ或163郵箱)至marketing@cloudsientific.com
b) 關注康昱盛微信公眾號并轉發“為新冠研究加油!GENEVESTIGATOR®免費試用一個月!附加免費課程!”本條微信至朋友圈,集齊11個贊,截圖。

收到您的申請后,我們將在一個工作日聯系您。

參考文獻:
[1] Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. The Lancet, DOI: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30251-8
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